第二季将继续描述马可波罗与忽必烈的关系。随着元王朝的兴起，宋王朝即将覆灭。但是南宋的支持者在南方建立起小朝廷，继续与蒙古可汗对抗，尽快统一全国成了忽必烈的当务之急。在此过程中，每个人的忠诚度都将受到考验——要想获得权力，就必须付出代价。Gabriel Byrne在第二季中扮演教皇格雷戈里十世（Pope Gregory X）。得到西方人认可的「国际动作巨星」杨紫琼扮演一个神秘角色，她的故事与百眼（Hundred Eyes）的背景有关。Ron Yuan扮演乃颜王子（Nayan），他后来成为一名基督教徒。 根据史料记载，乃颜是成吉思汗幼弟铁木哥斡赤斤玄孙，乃颜祖父塔察儿曾以东道诸王之长率先拥戴忽必烈为汗，因而特受尊崇。乃颜继其父阿木鲁为斡赤斤分地之主。1287年4月，他联合合撒儿后王势都儿、合赤温系诸王哈丹秃鲁干等，在漠北份地举兵反元。忽必烈御驾亲征，并且大胆乘象舆临阵。乃颜军用强弓射击象舆，忽必烈这才下舆御马。在漠北地区乘象督战是一件空前绝后的事情，因此这个细节也被穆斯林史籍和当时在元朝宫廷的马可波罗记录下来，第二季会再现这一段历史。